T-DNA标签在转基因水稻基因组中的整合特点

• 作者: 何朝族 李述田 田颖川
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻(Oryza sativa L.)基因组,T-DNA标签,整合特点
• 年，卷（期）: 2004,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 912-917
• 页数: 6页
• 分类号: Q7
• 字数: 3552字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2004.10.010

摘要

利用热不对称交错PCR(TAIL-PCR),对200个含T-DNA插入的转基因水稻株系进行分析,获得了159个T-DNA右边界侧翼序列.其中,92个序列含有T-DNA右边界和侧邻的水稻基因组序列,78个序列与已公布的水稻BAC/PAC克隆有97%～100%的同源性,从而可作为T-DNA标签定位在水稻的12条染色体上.结合先前定位的169个T-DNA标签,对T-DNA在水稻基因组中的整合特点进行了分析.结果发现,在T-DNA右边界和侧邻的水稻基因组序列的连接处,14.6%的T-DNA标签含有3～74bp的填充序列.在不含填充序列的连接处,21.3%的T-DNA标签,在整合后的T-DNA右边界与侧翼的水稻基因组序列之间显示出3～5 bp的微同源性.填充序列和微同源性的存在,揭示了T-DNA在水稻基因组中的整合既存在双链断裂修补机制,又存在单链裂缝修补机制.T-DNA倾向于整合到富含A/T核苷酸的基因组区域,即主要在基因的5'和3'端调控区以及内含子中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田颖川	中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室	52	2334	28.0	48.0
2	李述田	中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室	1	13	1.0	1.0
6	何朝族	中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室	9	220	8.0	9.0