6种笛鲷属鱼类线粒体16SrRNA基因片段的序列比较

• 作者: 吕俊霖 周发林 江世贵 苏天凤
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 笛鲷属 线粒体DNA 16S rRNA 序列比较
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 99-103
• 页数: 5页
• 分类号: Q959.483
• 字数: 2766字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2004.02.003

摘要

对笛鲷属(Lutjanus)的紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)、白星笛鲷(Lutjanus stellatus)、千年笛鲷(Lutjanus sebae)、勒氏笛鲷(Lutjanus russellii)、红鳍笛鲷(Lutjanus erythropterus)线粒体DNA 16S rRNA 基因片段进行了PCR 扩增和测序,得到长度约418 bp的序列.结合GenBank中斜带笛鲷(Lutjanus decussatus)该区段的16S rRNA序列,用Clustal_X排序软件进行16S rRNA序列的对位排列.通过Mega 2.1软件对所得线粒体16S rRNA片段序列进行比较,共检测53个碱基存在变异,其中包括21个简约信息位点,并用"Pairwise distance"计算了各属间的相对遗传距离,结果表明,其序列差异(转换+颠换)在0.027～0.083,其中勒氏笛鲷与斜带笛鲷的序列差异最小, 红鳍笛鲷与勒氏笛鲷的序列差异最大.以高体四长棘鲷(Argyrops spinifer)为外类群,采用Mega 2.1软件中的"Neighbore-Joining"法得到唯一1个分子系统树,系统树各分支的置信度由"Bootstrap"1000 循环检验.结果表明,6种笛鲷鱼类聚成明显的3个分支,第1个分支,包括勒氏笛鲷、斜带笛鲷和白星笛鲷;第2个分支,包括紫红笛鲷;第3个分支,包括红鳍笛鲷和千年笛鲷.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏天凤	中国水产科学研究院南海水产研究所	58	1015	17.0	29.0
2	江世贵	中国水产科学研究院南海水产研究所	100	1501	22.0	31.0
3	吕俊霖	中国水产科学研究院南海水产研究所	15	182	8.0	13.0
4	周发林	中国水产科学研究院南海水产研究所	46	696	17.0	24.0