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摘要:
参考对虾溶菌酶基因和类溶菌酶基因及其他多种生物的溶菌酶基因序列,设计并合成引物.运用RT-PCR技术,从斑节对虾血细胞总RNA中扩增获得特异性片段.所获片段回收纯化后克隆到pGEM-T Easy Vector系统的T载体上.重组子的序列分析表明,所克隆的斑节对虾溶菌酶基因片段长658bp,包括溶菌酶基因开放阅读框(ORF)477bp和3′端非编码区的181bp.477bp ORF共编码158个氨基酸,包括溶菌酶成熟肽140个氨基酸残基和信号肽18个氨基酸残基.斑节对虾溶菌酶成熟肽推测分子量为16,32kd,等电点为8.78.与南美白对虾溶菌酶基因的碱基序列及推测氨基酸序列比较,同源性分别为89.5%和93.0%;与日本对虾类溶菌酶基因的同源性分别为84.0%和91.0%.进一步的序列分析表明,斑节对虾溶菌酶氨基酸序列与多种类群生物的 c-型溶菌酶氨基酸序列具有较高的同源性,并具有与c-型溶菌酶相同的活性位点氨基酸残基 Glu51和 Asp68,且与活性位点相邻的序列高度保守.斑节对虾溶菌酶氨基酸序列还具有与c-型溶菌酶相同的结构氨基酸--8个半胱氨酸残基.因而可认为所克隆的斑节对虾溶菌酶基因属c-型溶菌酶基因.
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文献信息
篇名 斑节对虾溶菌酶基因克隆及序列分析
来源期刊 水生生物学报 学科 农学
关键词 斑节对虾 溶菌酶 克隆 序列分析
年,卷(期) 2004,(4) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 413-417
页数 5页 分类号 S945.4
字数 3332字 语种 中文
DOI 10.3321/j.issn:1000-3207.2004.04.014
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 白俊杰 中国水产科学研究院珠江水产研究所 104 1312 20.0 28.0
2 叶星 中国水产科学研究院珠江水产研究所 84 1239 20.0 31.0
3 吴锐全 中国水产科学研究院珠江水产研究所 61 881 19.0 27.0
4 罗建仁 中国水产科学研究院珠江水产研究所 61 724 17.0 22.0
5 郑清梅 中国水产科学研究院珠江水产研究所 4 122 4.0 4.0
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斑节对虾
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相关学者/机构
期刊影响力
水生生物学报
双月刊
1000-3207
42-1230/Q
大16开
湖北省武汉市武昌珞珈山水生所 (武昌东湖南路7号)
82-329
1955
chi
出版文献量(篇)
3348
总下载数(次)
8
总被引数(次)
54594
相关基金
广东省自然科学基金
英文译名:Guangdong Natural Science Foundation
官方网址:http://gdsf.gdstc.gov.cn/
项目类型:研究团队
学科类型:
论文1v1指导