戊型肝炎病毒摩洛哥株非编码区基因序列鉴定及基因型分型

• 作者: 孟继鸿 陈国兵
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 戊型肝炎病毒 摩洛哥株 非编码区 基因型
• 年，卷（期）: 2004,（10）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 828-833
• 页数: 6页
• 分类号: R5
• 字数: 5340字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2004.10.019

摘要

目的检测戊型肝炎病毒(HEV)摩洛哥株非编码区(UTR)序列,探讨HEV非编码区序列能否作为其基因型分型的依据. 方法使用基于RNA连接酶的cDNA末端快速扩增法(RLM-RACE)扩增HEV摩洛哥株5′和3′端片段并测序.所得序列使用LASERGENE和PHYLIP软件包与其他29株HEV序列比较. 结果只有基于甲基化帽子结构的RLM-RACE扩增出了5′端片段.HEV摩洛哥株5′端UTR有26个核苷酸,3′端polyA之前有65个核苷酸.基于3′端UTR序列的进化树与基于全基因序列的进化树不全相同.HEV 3′端至少需要100个左右核苷酸长的序列才可进行HEV基因型分型. 结论 HEV摩洛哥株5′端有甲基化帽子结构.HEV 3′端UTR序列不能完全代替全基因组序列进行基因型分型.部分序列替代全基因组进行基因型分型时需要考虑其部位和长度因素.