华南流感病毒NS1基因特性研究

• 作者: 张志珍 李康生 段炼
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 医学
• 关键词: 流行性感冒病毒 NS1基因 序列分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 237-243
• 页数: 7页
• 分类号: R373.13|Q522.6
• 字数: 4551字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2004.03.009

摘要

为了解H9N2和H5N1亚型流行性感冒病毒株的NS1基因特性,采用RT-PCR方法测定了12株2000～2003年间在华南地区分离的禽流感病毒株的NS1基因核苷酸序列. 测序显示6株H9N2亚型流感病毒NS1基因开放阅读框(ORF)长654 bp,编码217个氨基酸. 6株H5N1亚型毒株NS1基因ORF长678 bp,编码225个氨基酸. 核苷酸和氨基酸同源性分析表明,同一亚型分离株之间有很高的同源性,而不同亚型的H9N2和H5N1毒株之间存在较大差异. BLAST分析表明,H5N1和H9N2亚型流感病毒分离株的NS1基因分别与近两年从香港特区和华南地区的鸭中分离的毒株A/Duck/Hong Kong/646.3/01 (H5N1)、A/Duck/Shantou/2143/01 (H9N2)有很高的亲缘关系. 该研究结果为进一步进行NS1功能研究奠定了基础.