根据cpDNA trnL-F非编码区序列变异分析黑桫椤海南和广东种群的遗传结构与系统地理

• 作者: 欧阳蒲月 江宇 王伯荪 王艇 苏应娟 郑博 陈国培
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 黑桫椤 cpDNA trnL-F非编码区 单倍型 遗传结构 地理分化
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 页码范围: 914-919
• 页数: 6页
• 分类号: Q234|Q941|Q948
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0933.2004.05.008

摘要

以黑桫椤分布在海南和广东9个种群为材料,通过PCR产物直接测序和克隆后再测序的方法测定了叶绿体DNA(cpDNA)trnL-F非编码区序列.序列长度介于1017bp至1021bp;碱基组成A+T含量较高,百分比值为60.43%～62.26%.根据序列的核苷酸变异共鉴定出15个单倍型.黑桫椤具高水平单倍型多样性(h=0.880)和较高水平核苷酸多样性(Dij=0.00342),其悠长的进化历史可能增加了遗传变异在谱系内的积累.单倍型最小生成网图和邻接树、种群间分化度(FST=0.12645)和基因流(Nm=3.49)、AMOVA分析(地区间遗传变异占11.91%,P＞0.05)以及DNA歧义度结果一致显示,黑桫椤分布在海南和广东的种群彼此间不存在遗传分化.黑桫椤单倍型的系统发育地理式样具"星状"特征,提示种群在历史上曾经发生过扩张,扩张后的种群还未能获得足够时间去建立更加复杂的结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王伯荪	中山大学生命科学学院	91	3820	39.0	57.0
2	苏应娟	中山大学生命科学学院	48	804	18.0	27.0
3	王艇	中山大学生命科学学院	29	755	16.0	27.0
4	郑博	中山大学生命科学学院	7	160	5.0	7.0
5	江宇	中山大学生命科学学院	3	60	3.0	3.0
6	欧阳蒲月	中山大学生命科学学院	5	81	3.0	5.0
7	陈国培	中山大学生命科学学院	6	139	5.0	6.0