不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析

• 作者: 周童 孙啸 陆祖宏 顾万君 马建民
• 来源期刊: 东南大学学报(自然科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: 同义密码子使用 氨基酸二级结构偏向性 蛋白质二级结构预测 蛋白质折叠类型 蛋白设计
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 页码范围: 72-77
• 页数: 6页
• 分类号: Q52
• 字数: 4789字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-0505.2004.01.017

摘要

在传统的Chou-Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息,计算了200个蛋白(49种全α结构蛋白,69种全β结构蛋白,38种α+β结构蛋白,44种α/β结构蛋白)中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构(α:螺旋,β:折叠,C:卷曲)的偏向性参数.通过对这些密码子对应氨基酸二级结构偏向性的分析,得到了氨基酸二级结构偏向性分析中所忽略的同义密码子的蛋白结构信息.这些新的信息量对于指导蛋白质设计以及提高蛋白质二级结构预测的准确率有着一定的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙啸	东南大学吴健雄实验室	71	488	12.0	20.0
2	陆祖宏	东南大学吴健雄实验室	166	1602	19.0	33.0
3	周童	东南大学吴健雄实验室	9	157	5.0	9.0
4	马建民	东南大学吴健雄实验室	6	143	5.0	6.0
5	顾万君	东南大学吴健雄实验室	8	146	5.0	8.0