拟南芥抗旱转录因子CBF4基因区域的核苷酸多样性及其分子进化分析

• 作者: Dominique Brunel Georges Pelletier 吴忠义 曹鸣庆 杨清 郝岗平 黄丛林
• 来源期刊: 遗传学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 CBF4基因 核苷酸多样性
• 年，卷（期）: 2004,（12）
• 所属期刊栏目: 植物和微生物遗传学
• 页码范围: 1415-1425
• 页数: 11页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 7761字
• 语种: 中文

摘要

以生长于不同气候条件下的17个拟南芥核心生态型为材料,分析了它们的抗旱转录因子CBF4 基因区域的序列多态性.结果表明:拟南芥CBF4基因区域具有高密度的单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失(Indel),多态性频率为每35.8 bp一个 SNP,每143 bp一个Indel,基因非编码区的多态性是编码区的4倍;在编码区,SNP的频率为每96.4 bp一个SNP,其中发现25 av、203 av和244 av 3个生态型CBF4基因区域1 034位 (以GenBank登录号AB015478序列第19 696位的核苷酸为1)碱基变化:G(←→)T,引起第205位氨基酸变化:gly(←→)val.核苷酸多样性统计分析显示,该基因内部大范围内存在连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD),5′端非编码区有一个重组.与拟南芥等的研究结果类似,选择压力对不同的区域作用不同.3′端非编码区核苷酸多样性程度最高,是平衡性选择的结果,编码区核苷酸变化符合中性突变假说,而5′端非编码区是自然选择作用的靶位点.