SARS病毒再测序DNA微阵列的探针设计

• 作者: 孙啸 方辉 谢建明 陆祖宏
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 探针设计 再测序DNA微阵列 SARS病毒 Tm距离 遗传算法
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 30-31
• 页数: 2页
• 分类号: Q617
• 字数: 2935字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-311X.2004.01.013

摘要

探针设计是SARS病毒再测序DNA微阵列制作的关键步骤,为了保证探针的杂交条件尽可能一致,采用了作者提出的两种等长变覆盖的探针设计方法,即基于Tm距离的算法和遗传算法.针对SARS病毒基因组中的两段特异序列设计了一组探针,并与等长移位法和变长变覆盖法的设计结果进行了比较.等长变覆盖法得到的探针集在探针长度一致的情况下,探针的Tm值有较小的标准差和变化范围.结果表明,等长变覆盖法得到的探针具有更好的杂交条件一致性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙啸	东南大学分子与生物分子电子学教育部重点实验室	71	488	12.0	20.0
2	陆祖宏	东南大学分子与生物分子电子学教育部重点实验室	166	1602	19.0	33.0
3	谢建明	东南大学分子与生物分子电子学教育部重点实验室	50	187	7.0	10.0
4	方辉	东南大学分子与生物分子电子学教育部重点实验室	3	2	1.0	1.0