N-甲基-N'-硝基-N-亚硝基胍诱导共表达的蛋白基因启动子区的转录因子结合部位分析

• 作者: 余应年 刘天婵
• 来源期刊: 中国病理生理杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 进化足迹法 转录因子结合部位 凝胶阻滞试验 甲基硝基亚硝基胍
• 年，卷（期）: 2004,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1953-1960
• 页数: 8页
• 分类号: R318|Q75
• 字数: 5268字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-4718.2004.11.001

摘要

目的:分析甲基硝基亚硝基胍(MNNG)诱导的共表达蛋白的编码基因启动子区的转录因子结合部位.方法:用进化足迹法,结合转录因子数据库的搜索,预测共表达蛋白编码基因启动子区共有的转录因子结合部位.凝胶阻滞试验验证对于预测出的转录因子结合部位,在MNNG处理细胞中是否确实有相关转录因子的反应.结果:预测出11个共同存在于这些蛋白编码基因启动子区的转录因子结合部位,其中除已知转录因子激活蛋白1(activator protein 1, AP1)在MNNG处理后被激活外,用凝胶阻滞试验又发现在MNNG处理细胞的核提取液中有2个转录因子 - 核因子Y(nuclear factor, NFY)和GATA 结合因子(GATA binding factor, GATA)的活性升高.结论:进化足迹法可以有效地降低转录因子结合部位预测结果中的假阳性率.NFY和GATA转录因子结合部位可能参与对MNNG诱导的共表达蛋白的共调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余应年	浙江大学医学院病理生理学教研室	57	420	10.0	18.0
2	刘天婵	浙江大学医学院病理生理学教研室	2	28	2.0	2.0