钩体LPS生物合成与装配途径及相关基因分析

• 作者: 何建勇 张怡轩 缪有刚 耿燕 赵国屏 郭晓奎
• 来源期刊: 中国人兽共患病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 问号钩体 LPS 生物合成 生物信息学
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 5-9,4
• 页数: 6页
• 分类号: R378
• 字数: 5410字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2004.01.002

摘要

目的预测问号钩体黄疸出血型赖株脂多糖(LPS)合成、装配途径,并对其中几个关键基因的特征进行深入分析.方法使用NCBI/BlastX,ProDom/Blast,Jpred2,TMHMM对问号钩体黄疸出血型赖株全基因组ORF基因所编码蛋白进行在线分析,并使用Bioedit,Pep Tool软件进行蛋白质一、二级结构分析.结果确定了脂质A和核心多糖生物合成基因lpxA、lpxB、lpxC、lpxD、lpxK、kdsA、kdsB、kdtA、lnt、htrB和O-抗原生物合成基因簇rfb locus 等以及装配、跨膜转运中的基因rfbP、rfbX、rfc、rfaL、rfe绘制了LPS合成及装配途径示意图.并对合成和装配途径中几个关键的基因编码蛋白(LpxA、 Rfc、 RfbX、 RfaL)的二级结构、跨膜区域、结构域等进行了分析.结论问号钩体黄疸出血型赖株LPS合成、装配途径与典型的革兰阴性菌,如大肠埃希菌K-12相似,主要差异在于钩体特殊的脂肪酸代谢途径和O-抗原多糖结构.该研究为进一步探讨钩体LPS基因功能及其与致病性关系奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭晓奎	上海第二医科大学病原生物学教研室	43	241	8.0	13.0
2	何建勇		55	294	10.0	14.0
3	赵国屏	中国科学院上海生命科学院	52	207	7.0	11.0
5	张怡轩	中国科学院上海生命科学院	61	387	11.0	17.0
9	缪有刚	中国科学院上海生命科学院	7	82	4.0	7.0
12	耿燕	中国科学院上海生命科学院	1	3	1.0	1.0