毛细管电泳法检测肝细胞癌微卫星不稳定性的影响因素

• 作者: 丛文铭 冼志红 张树辉
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 年，卷（期）: 2004,（8）
• 所属期刊栏目: 肝癌
• 页码范围: 1781-1784
• 页数: 4页
• 分类号: R3
• 字数: 4898字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2004.08.006

摘要

目的:探索适用于肝癌大规模基因组扫描的自动化微卫星不稳定性基因分型实验方法.方法:应用6对高度多态性微卫星标记物对56例肝细胞癌基因组进行PCR扩增,产物通过MegaBACE 500毛细管电泳测序仪进行电泳,采用Genetic Profiler软件进行基因分型,摸索不同PCR条件以及PCR体系残留混合物对分型结果的影响.结果:通过1次PCR和电泳能得到48个样品的分型结果,常见的等位基因表型包括杂合子、纯合子、杂合子丢失、微卫星不稳定性和等位基因失衡等几种模式,其中微卫星不稳定性基因表型呈多种特征;MSI的频率为32.1%(18/56),10例(18.2%)出现高频MSI;PCR反应体系残留混合物(dNTP、引物和盐离子的浓度等)对基因分型的结果有明显不利影响,可使等位基因片段大小分析结分错误导致结论错误;样品浓度对分析结分影响较小,在50 mg/L时比较合适.结论:少数肝细胞癌存在MSI,表明其在HCC发生中作用较小.应用MegaBACE 500毛细管电泳测序仪和GeneticProfiler分析软件进行微卫星基因组扫描效率高,结果可靠,但测序体系中必须维持最佳盐离子的浓度和样品浓度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冼志红	中国人民解放军第二军医大学东方肝胆外科医院病理科	1	5	1.0	1.0
2	丛文铭	中国人民解放军第二军医大学东方肝胆外科医院病理科	4	40	4.0	4.0
3	张树辉	中国人民解放军第二军医大学东方肝胆外科医院病理科	1	5	1.0	1.0