人ligatin样基因HCA56的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 冯进波 孙宝柱 曲迅 杨美香 闫实
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 生物学
• 关键词: SEREX HCA56 Ligatin 生物信息学
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 14-16
• 页数: 3页
• 分类号: Q7
• 字数: 2620字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2004.01.006

摘要

目的利用SEREX方法筛选人肝细胞癌(HCC)cDNA表达文库,克隆能引起机体体液免疫应答的抗原编码基因,并对其进行生物信息学分析,以指导对新克隆基因功能的研究.方法采用ZAP-cDNA Gigapack Ⅲ Gold Cloning试剂盒构建人HCC cDNA表达文库,用患者自体血清进行筛选,对筛选得到的阳性克隆进行序列测定.通过生物信息学对筛选得到的阳性克隆HCA56进行染色体定位、基因结构分析、蛋白序列预测以及相似性搜索和功能分析.逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)检测HCA56的组织表达谱.结果通过对一个cDNA表达文库的筛选,获得了一个血清反应阳性克隆HCA56,全长2021bp,编码584个氨基酸,定位于染色体1q31～q32.数据库搜寻表明它与人ligatin编码基因片段有95%的相似性.RT-PCR显示HCA56广泛分布于各种正常组织.结论 HCA56很可能是ligatin的全长编码基因,生物信息学与分子生物学相互结合是进行新基因研究的有效方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙宝柱		18	43	4.0	5.0
2	冯进波		33	185	8.0	11.0
3	杨美香		32	143	6.0	10.0
4	曲迅		95	471	12.0	15.0
5	闫实		10	78	5.0	8.0