表达序列标签数据库搜索克隆斑马鱼QM基因及其数字化差异显示分析

• 作者: 邵健忠 金红建 项黎新
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 斑马鱼 QM基因 表达序列标签 电子克隆 数字化差异显示分析
• 年，卷（期）: 2005,（5）
• 页码范围: 599-605
• 页数: 7页
• 分类号: S917
• 字数: 4657字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2005.05.003

摘要

QM基因是一种与肿瘤抑制、细胞生长、分化、发育和凋亡等有关的重要基因,已在人类及许多物种中得到了克隆,但鱼类中尚无报道.我们利用表达序列标签数据库和电子克隆等技术,成功克隆了斑马鱼QM基因,并对该基因的结构进行了系统分析.结果显示,斑马鱼QM基因cDNA全长769 bp,含648 bp开放阅读框架,编码215个氨基酸,5'UTR 25 bp,3'UTR122 bp,所编码的QM多肽分子量24.6 kDa,等电点(pI)10.6,含潜在的蛋白酶C磷酸化位点、N-酰基化位点和酰胺化位点.比较斑马鱼QM和人等13个物种QM的同源性,发现其氨基酸序列相似性为66%～92%.数字化差异显示分析结果表明,QM基因在斑马鱼胚胎及成体多种组织中均有广泛表达.研究结果为今后利用生物信息学快速克隆新的鱼类功能基因打下了方法学基础,也为进一步研究鱼类QM基因功能提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵健忠	浙江大学生命科学学院	50	1086	19.0	31.0
2	项黎新	浙江大学生命科学学院	33	626	14.0	24.0
3	金红建	浙江大学生命科学学院	2	23	2.0	2.0