家蚕核型多角体病毒bro基因的单核苷多态性研究

• 作者: 周泽扬 庞敏 李艳红 潘国庆 王霞
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 家蚕核型多角体病毒 bro基因 单核苷多态性 插入/缺失 Tajima'D检验
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 294-299
• 页数: 6页
• 分类号: S884.5+1|Q503
• 字数: 3553字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2005.03.012

摘要

bro(baculovirus repeated ORFs)基因家族是一类存在于核型多角体病毒中比较复杂的基因家族.家蚕核型多角体病毒T3 BmNPV基因组中有5个bro基因,分别为bro-a,bro-b,bro-c,bro-d,bro-e.对我国的BmNPV CQ1株进行了全基因组测序,与T3序列比较发现两个差异较大区域,分别命名为V1,V2区.在此基础上,对来自国内不同地区的另外5株BmNPV分离株对应的差异区域进行了研究,克隆了包含15个bro基因的10个DNA片段,其中包含了5个bro-c基因序列,5个bro-d基因序列,4个bro-e基因序列,加上公共数据库中已有的2个bro-c、2个bro-d、1个bro-e,合并后对bro-c、bro-d、bro-e分别进行核苷酸多态性分析,结果表明bro-c、d、e类基因都存在高密度的SNP位点.出现在这3类基因中的单核苷酸位点或核苷酸片段的插入/缺失数目分别为9、1、1.(θ,π)分析表明bro-c类基因的多态性在3类bro基因中最高.Tajima'D检验结果说明这些核苷酸变化符合中性突变假说.Pi(a)/Pi(s)分析暗示bro-c,bro-d和bro-e的N端的一些区段受到正向选择.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周泽扬	西南农业大学农业部蚕桑学重点开放实验室	73	422	11.0	18.0
5	潘国庆	西南农业大学农业部蚕桑学重点开放实验室	9	81	6.0	9.0
6	李艳红	西南农业大学农业部蚕桑学重点开放实验室	2	24	2.0	2.0
7	王霞	西南农业大学农业部蚕桑学重点开放实验室	2	28	2.0	2.0
8	庞敏	西南农业大学农业部蚕桑学重点开放实验室	1	10	1.0	1.0