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中国、日本和澳大利亚珍珠贝的ITS 2序列特征分析
中国、日本和澳大利亚珍珠贝的ITS 2序列特征分析
作者:
吴开畅
喻达辉
李有宁
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
合浦珠母贝
内部转录间隔子
DNA序列分析
地理亲缘关系
摘要:
对中国、日本和澳大利亚的珍珠贝核糖体DNA第二内部转录间隔子(ITS 2)的序列特征进行了分析.PCR扩增产物包括5.8 S基因部分序列、ITS 2基因和28 S基因部分序列.去除引物序列后5.8 S基因片段长64bp,ITS 2长230~237 bp,28 S基因片段长249 bp.共分析了16个基因型的序列特征,结果表明,5.8 S和28 S基因片段高度保守,仅28 S有1个碱基位点突变;而ITS 2变异大,237个比对位点中有20个位点发生突变,其中12个位点为缺失/插入突变,4个简约信息位点.在碱基组成中,5.8 S和28 S的GC含量(58.1%~59.4%)高于AT含量,也高于ITS 2的GC含量(51.3%~52.0%),ITS 2的GC含量与AT含量相差不大.碱基组成中5.8 S的A碱基含量较低,28 S的T碱基含量较低,存在较大的碱基偏倚性.3个地理群体内和群体间的遗传距离都很小(0.010~0.013),且相互重叠.从基因型数据看,3个群体既有各自独立的基因型,也有共享基因型.但从序列的碱基变异数据看,3个群体没有各自独有的突变位点.上述结果表明,3个地理群体既具有丰富的遗传多样性,又具有高度的遗传一致性,即亲缘关系近,可能存在基因交流,或者分化时间不长.丰富的遗传多样性有利于合浦珠母贝的遗传选育.
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企鹅珍珠贝
贝龄
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湿重
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内容分析
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相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
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关键词热度
相关文献总数
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文献信息
篇名
中国、日本和澳大利亚珍珠贝的ITS 2序列特征分析
来源期刊
南方水产
学科
生物学
关键词
合浦珠母贝
内部转录间隔子
DNA序列分析
地理亲缘关系
年,卷(期)
2005,(2)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1-6
页数
6页
分类号
Q523+.8
字数
3077字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-0780.2005.02.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
喻达辉
中国水产科学研究院南海水产研究所
55
800
18.0
26.0
2
吴开畅
中国水产科学研究院南海水产研究所
30
352
11.0
17.0
3
李有宁
中国水产科学研究院南海水产研究所
15
180
8.0
13.0
传播情况
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引文网络
引文网络
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研究主题发展历程
节点文献
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内部转录间隔子
DNA序列分析
地理亲缘关系
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方水产科学
主办单位:
中国水产科学研究院南海水产研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
2095-0780
CN:
44-1683/S
开本:
大16开
出版地:
广州市新港西路231号
邮发代号:
46-65
创刊时间:
1963
语种:
chi
出版文献量(篇)
1477
总下载数(次)
2
总被引数(次)
15753
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
重点项目
学科类型:
信息技术
广东省自然科学基金
英文译名:
Guangdong Natural Science Foundation
官方网址:
http://gdsf.gdstc.gov.cn/
项目类型:
研究团队
学科类型:
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南方水产科学2005年第2期
南方水产科学2005年第1期
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