中国部分猪种SLA-DQB外显子2遗传多样性

• 作者: 张亚平 李华 邱祥聘
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 中国猪种 SLA-DQB 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 173-180
• 页数: 8页
• 分类号: S828.8
• 字数: 3952字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2005.02.001

摘要

运用PCR-SSCP和克隆测序对中国部分猪种的SLA-DQB基因外显子2的多态性分析表明:有功能的DQB基因有68个新等位基因,假基因(SLA-DXB)等位基因有5个.各等位基因的数量分布极其不平衡,而且许多品种都表现出共享等位基因.9个主要等位基因中,C08广泛分布在中国猪种的6大地方类型11个品种及云南和四川野猪中,它为中国猪种特有的共享等位基因,占总数的55.10%.在单一的个体中拥有5条以上序列,说明SLA-DQB基因座在某些品种中拷贝数为3个.SLA-DQB外显子2的等位基因核苷酸和氨基酸多态变异位点分别高达81个和49个,等位基因多样度(H=0.889)以及核苷酸多样度(Pi=0.047)都很高,总体表现为β折叠区的Pi值均高于α螺旋区.综合分析表明华南型、西南型猪H和Pi均较高,高原型的藏猪最低.类群内遗传距离排序与Pi值高低排序一样,可见各地方类型中核苷酸替换的差异正比于核苷酸多样度.类群间遗传距离比较,江海型与华北型间的距离最大,而华中型和高原型间的遗传距离最小.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李华	中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室	189	3087	30.0	49.0
7	张亚平	中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室	130	3019	30.0	51.0
8	邱祥聘	四川农业大学动物科技学院	29	459	12.0	21.0