SSR荧光标记和银染技术的比较分析

• 作者: 张学勇 王兰芬 董玉琛 贾继增 郝晨阳
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 小麦 微卫星 荧光PCR 基因组扫描
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 144-149
• 页数: 6页
• 分类号: S512|Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0496-3490.2005.02.002

摘要

应用多重PCR简单重复序列(SSR)荧光标记分析技术和常规的SSR银染技术,对北方冬麦区451份材料(中国小麦初选核心种质的一部分)进行分析,用相同材料和引物,对这两种方法的检测效果进行评价.用24对引物扩增,银染法共检测出235个等位变异,每个位点检测到的等位变异为3～20,平均为9.8个,多态性信息指数PIC为0.22～0.93,平均0.74;而荧光标记可检测到312个等位变异,每个位点检测到的等位变异为4～24,平均为13.0个,PIC为0.32～0.97,平均0.75.荧光技术较银染方法在每个位点上多检测到3个等位变异,检测效果更为理想,更适于进行遗传多样性分析和研究;对两种方法的费用和工作效率做了初步分析,表明完成5 000×78个反应在费用基本持平的情况下,微卫星荧光标记技术的检测效率显著高于银染法(7.8倍).同时对微卫星荧光标记技术中低成本、高通量多重PCR体系的建立及Genescan 3.7、Genotyper 3.7软件数据分析中出现的一些具体问题进行了探讨.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贾继增	中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物品种资源与生物技术重点实验室	60	3975	33.0	60.0
2	董玉琛	中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物品种资源与生物技术重点实验室	20	951	12.0	20.0
3	王兰芬	中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物品种资源与生物技术重点实验室	14	422	5.0	14.0
4	郝晨阳	中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物品种资源与生物技术重点实验室	2	174	1.0	2.0