大鼠基因组中硒蛋白的信息学研究

• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 生物学
• 关键词: 硒代半胱氨酸 硒蛋白 SECIS 3′-UTR 生物信息学
• 年，卷（期）: 2005,（4）
• 所属期刊栏目: 计算机化学
• 页码范围: 261-264
• 页数: 4页
• 分类号: Q524
• 字数: 2560字
• 语种: 中文

摘要

UGA码具有双重功能.通常情况下是蛋白质合成的终止码,当mRNA下游链上出现硒代半胱氨酸插入元件时(SECIS),UGA码就可能成为指导硒代半胱氨酸(Sec)直接进入蛋白质的密码子.SECIS是mRNA链上的一种特殊的二级结构,在原核生物和真菌中出现在紧邻UGA码的下游,而在真核生物中它则是出现在UGA码所在阅读框后面的3′-非翻译区(3′-UTR).根据SECIS特征序列中3个腺嘌呤位置不同可以将其分为Ⅰ型和Ⅱ型.用Genetool、SECISearch、RNADraw以及Dnassist等计算机软件可以对已测序的生物物种基因组进行处理从中找出和发现硒蛋白基因.