15种鱼转铁蛋白cDNA序列密码子使用比较分析

• 作者: 王祖荣 龙华
• 来源期刊: 南方水产
• 学科: 生物学
• 关键词: 鱼 转铁蛋白 cDNA 密码子 使用
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 6-10
• 页数: 5页
• 分类号: Q786
• 字数: 2097字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2005.01.002

摘要

运用DNAman v4.0分析软件,对克隆的鲫鱼血清转铁蛋白cDNA序列与文献中的14种鱼转铁蛋白cDNA序列的同源性、密码子使用频率和密码子使用偏性进行分析,结果表明:鲤形目鱼类Tf的cDNA序列同源性在46%以上,而鲑形目鱼类Tf的cDNA序列同源性在34%～99%之间,变化较大.密码子使用频率越高或使用偏性越小,说明该密码子编码的氨基酸对蛋白质空间结构的形成和基本生理功能的影响也越重要;在进化上分化时间越早的物种,密码子使用频率和使用偏性的差异较小,反之则较大;在同源性方面,在进化上比较接近的物种,基因的密码子使用频率和使用偏性指标比较接近或基本相同.根据对15种鱼Tf的cDNA序列同源性和密码子分析,推测Tf基因的进化顺序是:鲤形目、鳕形目、鲑形目和鲽形目.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龙华	中国水产科学研究院长江水产研究所农业部淡水鱼类种质资源与生物技术重点开放实验室	46	538	12.0	22.0
2	王祖荣	长江大学计算机科学学院	7	23	3.0	4.0