水稻抗病性反应的cDNA微阵列分析及一个新基因OsBTB的发现

• 作者: 庄晓峰 李德葆 董海涛
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 稻瘟病菌 cDNA微阵列 基因表达谱检测
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 221-228
• 页数: 8页
• 分类号: S435.111.41|S435.111.2
• 字数: 5123字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0412-0914.2005.03.006

摘要

利用含1106条水稻独立基因的cDNA微阵列,检测水稻近等基因系H7R/H7S受稻瘟病菌诱导8 h的表达谱差异.结果显示:基因表达谱变化明显,在980组有效数据中,共检测到170条基因的表达丰度发生显著变化,其中上调表达基因106条,下调表达基因64条.通过与NCBI水稻数据库进行BLASTn比对分析,发现这些差异表达基因包含β-1,3-葡聚糖酶、富甘氨酸蛋白在内的已知基因33条,未知基因137条.对10个未知基因进行生物信息学分析后,其中获得一个含全长基因并具有BTB/POZ结构域的克隆T007F02(http://www.estarray.org),该基因命名为OsBTB.该克隆的cDNA序列具有完整的ORF区,OsBTB上游具有典型的启动子区.结果经测序得到证实.高通量的RNA斑点杂交证实:在抗性供试水稻中,该基因在水稻接种稻瘟病菌早期(8～12 h)受诱导高表达;在感病品种中,该基因表达无明显改变.结果提示OsBTB基因在功能上可能与水稻抗瘟性过程密切相关.