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摘要:
运用比较分子力场(CoMFA)和比较相似性指数分析(CoMSIA)方法研究了50个HLA-A*0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的关系,另外15个表位九肽作为预测集用于检验模型的预测能力.结果表明,采用CoMSIA得到的构效关系模型(q2=0.608,r2=0.987,F=440.4,SD=0.111)要明显优于采用CoMFA得到的构效关系模型.在CoMSIA计算中,当引入疏水场时,三维构效关系模型得到明显改善,通过该三维构效关系模型,可较精确地估算预测集中15个CTL表位肽与HLA-A*0201间的亲和力(r2pred=0.703,SD=0.368).通过分析分子场等势面图在空间的分布,可以观察到表位肽分子周围的立体及疏水特征对表位肽与HLA-A*0201间结合亲和力的影响,从而为进一步对CTL表位肽进行结构改造并基于此进行治疗性疫苗分子设计提供理论基础.
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文献信息
篇名 HLA-A*0201限制性CTL表位肽的分子力场分析
来源期刊 重庆工商大学学报(自然科学版) 学科 医学
关键词 细胞毒性T淋巴细胞(CTL) 表位 CoMFA CoMISA
年,卷(期) 2005,(2) 所属期刊栏目 环境科学与化学
研究方向 页码范围 143-147,193
页数 6页 分类号 R392-33
字数 2455字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-058X.2005.02.010
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序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王虎承 重庆工商大学环境与生物工程学院 2 1 1.0 1.0
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细胞毒性T淋巴细胞(CTL)
表位
CoMFA
CoMISA
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
重庆工商大学学报(自然科学版)
双月刊
1672-058X
50-1155/N
16开
重庆市南岸区学府大道21号
1983
chi
出版文献量(篇)
3397
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6
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