稗草磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPCase)基因的克隆与分析

• 作者: 丁在松 张丽 张桂芳 肖俊涛 赵明
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 稗草 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶 基因克隆与分析
• 年，卷（期）: 2005,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1365-1369
• 页数: 5页
• 分类号: S451
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0496-3490.2005.10.022

摘要

为揭示C4野生植物稗草(Echinochloa crusgalli)PEPCase的结构和功能特点,探索改善作物高光效新途径,克隆了稗草(E. crusgalli)磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因(ppc)的cDNA全长,测序及同源性比较分析结果证实,稗草ppc的cDNA全长为2 886 bp,编码961个氨基酸(GenBank登录号:AY251482);核苷酸序列与谷子(Setaria italica)C3型、高粱(Sorghum bicolor) C3-2型、玉米(Zea mays) C3-2型、水稻(Oryza sativa)C3型磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的同源率分别达94.8%、93.2%、93.0%和89.7%.推导的氨基酸序列中C末端第771位氨基酸是丙氨酸(A),表明是一个C3型基因.与其他植物几种不同形式PEPCase进行的多重序列比对与系统进化分析结果也证实,此基因的核苷酸序列及其编码的氨基酸序列与所有参与对比的C3型序列的同源性均远远高于与C4型的同源性.与玉米、高粱C3-2型PEPCase的同源性分别高达96.5%、96.4%,与高粱、玉米的C3-1型PEPCase的同源性分别为84.3%、83.8%,而与谷子、玉米、甘蔗和高粱的C4型PEPCase的一致性相对较低,分别为82.2%、79.1%、77.1%和76.6%.因此进一步推论新克隆的稗草ppc基因属于C3-2型.对其编码的蛋白序列进行了结构域、活性位点和功能位点预测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵明	中国农业科学院作物科学研究所	172	4205	37.0	58.0
2	张丽	中国农业大学农学与生物技术学院	66	725	16.0	23.0
3	张桂芳	中国农业大学农学与生物技术学院	6	66	2.0	6.0
7	丁在松	中国农业科学院作物科学研究所	33	425	11.0	20.0
8	肖俊涛	中国农业大学农学与生物技术学院	3	132	3.0	3.0