RPLC-SDS-PAGE整体蛋白质分离与纳升毛细管液相色谱-串联质谱联用技术的研究及应用

• 作者: 孟庆芳 张养军 朱云平 李文瑞 杨兵 王京兰 田英华 蔡耘 贺福初 邓新宇 钱小红
• 来源期刊: 生命科学仪器
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质组学 反相液相色谱 SDS-PAGE 液-质联用
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文-分析化学卷
• 页码范围: 25-29
• 页数: 5页
• 分类号: Q51
• 字数: 3486字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7929.2005.02.006

摘要

采用RPLC-SDS-PAGE与纳升毛细管液相色谱-串联质谱联用技术对国际人类蛋白质组织(HUPO)提供的法国人肝脏蛋白质组表达谱的构建及其理化性质的统计分析,鉴定了2552条肽段,归结于402种蛋白质和240个蛋白质簇.蛋白质的pI分布范围为:4.29～11.57,分子量范围为:8,593～3,816,218Da,其中大于100kDa的蛋白质占到所鉴定蛋白质的10%,二者皆高于两维凝胶电泳的等电点和分子量范围(一般等电点3～10;分子量10～100kDa).另外,蛋白质组中不同蛋白质的疏水性分布显示大部分蛋白质为可溶性蛋白质,其中疏水性蛋白质占15%(GRAVY＞0的蛋白质).实验结果表明该技术路线兼顾了反相色谱分离度高和SAS-PAGE兼容性好的优点,可用于复杂组织或细胞中蛋白质组表达谱的构建或比较蛋白质组的研究,为蛋白质组学的方法学研究奠定了基础.