我国新分离ECHO30病毒VP1序列分析

• 作者: 姜仁杰 姜庆五 汪华 沈进进 赵雅男 陈胤忠
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: ECHO30 无菌性脑膜炎 肠道病毒 序列分析 同源性
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 101-105
• 页数: 5页
• 分类号: R373.34
• 字数: 3963字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2005.02.004

摘要

测定了引起2003年苏北地区无菌性脑膜炎暴发流行的病因病毒FDJS03分离株的VP1基因序列,并与国外同型流行毒株做比较,以了解本流行株的分子生物学特点及遗传变异规律.随机选取FDJS03分离毒株中的4株,用肠道病毒VP1序列的特异性引物008/011进行RT-PCR,扩增产物经凝胶纯化后测序.将序列输入GenBank,用BLAST程序进行核苷酸和氨基酸序列比对;选取32株不同地区不同年代的ECHO30分离毒株,在PHYLIP3.573c和TREE-PUZZLE5.0中构建进化树,比较它们完整VP1序列(876nt)的进化关系.核苷酸和氨基酸同源性比较结果证明:4株分离病毒均为ECHO30.进化树分析显示:本次FDJS03分离株与欧美20世纪70、80年代流行株亲缘关系最近,但自成一簇,与国外毒株仍然有地区差别.ECHO30的VP1基因进化有时间效应,但存在地区差异.本次流行的病原可能是单一基因型的ECHO30病毒.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜仁杰		19	127	7.0	10.0
2	沈进进		23	100	5.0	9.0
3	汪华		72	722	15.0	23.0
4	陈胤忠		20	112	6.0	10.0