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摘要:
对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16 SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7 410bp,其中5'端非编码区(5'UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6 582个核苷酸,编码一个含2 193个氨基酸残基的多聚蛋白,3'端非编码区长为83bp.Cox.A16 SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%.Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%.
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文献信息
篇名 柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析
来源期刊 病毒学报 学科 医学
关键词 柯萨奇病毒 基因组 手足口病 同源性分析
年,卷(期) 2005,(3) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 217-222
页数 6页 分类号 R373.23
字数 4172字 语种 中文
DOI 10.3321/j.issn:1000-8721.2005.03.009
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