H1N1猪流感广东株血凝素基因的克隆与序列分析

• 作者: 姚学萍 李海燕 杨焕良 胡永浩 赵有淑 陈化兰
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 流感病毒 血凝素基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 172-176
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65+9.5
• 字数: 3114字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2005.02.013

摘要

用RT-PCR方法扩增H1N1亚型猪流感病毒广东分离株A/Swine/GuangDong/711/2001 HA基因,对其进行了克隆和测序.结果显示,HA基因全长1 771 bp,共编码579个氨基酸.A/Swine/GuangDong/711/2001 HA基因编码的氨基酸序列中有8个糖基化位点,5个位于HA1基因的第27、28、40、104和287位点,3个位于HA2基因的21、153和213位点.与H1N1亚型猪流感经典毒株比较后发现,血凝素糖基化位点并不是高度保守的.将A/Swine/GuangDong/711/2001与自GenBank读取的1918年人流感毒株A/South Carolina/1/18、1991年人流感毒株A/MD/12/91和1997年猪流感毒株A/Swine/Wisconsin/238/97等进行核苷酸同源性比较分析,A/Swine/GuangDong/711/2001与A/South Carolina/1/18、A/MD/12/91和A/Swine/Wisconsin/238/97等毒株的核苷酸同源性分别为93.9%、94.7%和93.9%.从系统发生树来看,A/Swine/GuangDong/711/2001与A/South Carolina/1/18和A/Swine/Wisconsin/238/97的亲缘关系相近.