弥漫型胃癌基因表达谱聚类分析

• 作者: 刘炳亚 张庆华 张晓青 朱正纲 李炜 杨燕青 林言箴 金晓龙
• 来源期刊: 诊断学理论与实践
• 学科: 医学
• 关键词: 弥漫型胃癌 cDNA微阵列 基因表达谱 TNM分期
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 192-196
• 页数: 5页
• 分类号: R735.2|Q78
• 字数: 2908字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-2870.2005.03.005

摘要

目的:从转录组水平识别弥漫型胃癌与正常胃黏膜间的基因表达差异,探讨胃癌分子发生、发展的机制.方法:收集22例弥漫型胃癌患者的胃癌组织及其相应远切端的正常胃黏膜.采用含14 592个点的cDNA表达谱芯片建立胃癌基因表达谱.差异表达基因筛选标准为该基因在50%以上样本中肿瘤比正常组织荧光强度大2倍或以上(P＜0.05).采用系统聚类、方差分析(P＜0.05)等方法进行差异表达分析,实时定量RT-PCR方法验证芯片结果.结果:胃癌组织与正常胃黏膜间的差异表达基因共357个,其中表达上调者153个;表达下调者204个.上调基因的功能主要与细胞骨架运动、基质重建和细胞黏附、细胞周期调控及信号传导相关;下调基因主要与消化功能、细胞免疫防御、代谢、凋亡抑制及电子传递相关.实时定量PCR验证结果与芯片结果一致.结论:运用cDNA芯片进行弥漫型胃癌基因表达谱分析,有助于从分子水平全方位理解弥漫型胃癌发病机制及生物学特性,也有助于发现新的分子诊断指标和基因治疗靶标.