磁珠富集法与小片段克隆法筛选鲤微卫星的比较研究

• 作者: 孙效文 梁利群 贾智英 魏东旺 鲁翠云
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 磁珠富集 小片段克隆 鲤 微卫星
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 126-132
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.468
• 字数: 5106字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2005.02.003

摘要

用2种方法克隆黑龙江鲤(Cyprinus (Cyprinus) carpio haematopterus)的微卫星序列.这2种方法分别是:①经典的小片段DNA克隆库,用末端标记的[γ-32] ATP的CA重复序列为探针筛选;②将酶切获得的小片段DNA用结合有磁珠的并连接有15个CA重复序列的生物素进行富集,获得的含有CA重复的DNA片段并经过两次PCR扩增再克隆的方法获得富集微卫星片段的克隆库.从前一个方法的克隆库中筛选2000个菌落,获得阳性克隆45个,有22个含有微卫星,完美型的占63.6%,非完美型的占22.7%,混合型的占13.7%,重复次数超过10的有9个,占40.9%;从方法②的克隆库中筛选2600个菌落,获得阳性克隆1300个,测序其中的390个克隆,微卫星314个,完美型的占79.0%;非完美型的占14.3%;混合型的占6.7%,重复次数超过10的有293个,占93.3%.结果表明,用生物素结合磁珠富集法克隆微卫星效率高,成本低,所获微卫星质量高,是一种值得推荐的微卫星制备方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙效文	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	159	3935	35.0	57.0
2	梁利群	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	91	2491	28.0	47.0
3	贾智英	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	40	388	10.0	18.0
4	鲁翠云	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	47	1092	18.0	32.0
5	魏东旺	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	1	116	1.0	1.0