家蚕质型多角体病毒RDRP基因的序列测定及同源性分析

• 作者: 孙京臣 张勤奋 张景强 徐兴耀 戴伟君 杨艺峰 谭玉蓉
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 家蚕质型多角体病毒 dsRNA RDRP基因 同源性
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 53-58
• 页数: 6页
• 分类号: S884.5|Q78
• 字数: 4524字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2005.01.012

摘要

应用分段RT-PCR方法和分子克隆技术从家蚕质型多角体病毒(Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosis virus,BmCPV)中国株的dsRNA中成功地分3段克隆了RDRP基因(RNA-dependent RNA polymerase),大小分别为1 442、827、1 675 bp,进行了基因全序列拼接,获得3.7 kb的全长RDRP基因(GenBank序列号为:AY496445).通过在线blast分析,与BmCPV-1、DpCPV-1、LdCPV-1、LdCPV-14、TnCPV-15核苷酸同源性分别为89%、81%、81%、54.1%和50.9%,氨基酸同源性分别为96.5%、93.1%、92.9%、41.1%和33.5%.根据核苷酸同源性与氨基酸同源性构建的进化树具有较好的一致性.通过ClustalX软件分析,定位了该病毒RDRP基因的3个保守区域(酸性区,核苷酸结合的核心区和催化功能核心区).