高通量蛋白质组学研究中一种基于GO的蛋白质功能分析策略

• 作者: 吴松锋 徐筱杰 朱云平 李栋 欧阳曙光 王建 荔建琦 贺福初
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物信息学 蛋白质组学 表达谱 GO 蛋白质功能
• 年，卷（期）: 2005,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1026-1029
• 页数: 4页
• 分类号: Q61
• 字数: 963字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2005.11.005

摘要

挖掘高通量实验数据蕴含的生物学意义是蛋白质组学研究面临的一大挑战.基于等级化结构化的词汇表GO(Gene Onto1ogy)和相关数据库中的蛋白质功能注释,发展了一种对蛋白质组学研究中得到的表达谱(Expression profile)进行功能分析的策略.在对蛋白质表达谱进行功能注释的基础上给出蛋白质表达谱中蛋白质功能的分布,同时给出感兴趣功能类别的统计信息.这有助于对表达谱蛋白质功能的整体理解和深入的生物信息学分析.该策略已经成功应用胎肝蛋白表达谱研究中,用户可以通过访问网址http://www.hupo.org.cn/GOfact/使用或者下载我们的程序.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李栋		3	91	3.0	3.0
3	朱云平		6	307	4.0	6.0
4	贺福初		22	516	10.0	22.0
5	徐筱杰	北京大学化学与分子工程学院	101	1678	23.0	36.0
6	荔建琦		2	247	2.0	2.0
7	吴松锋		2	247	2.0	2.0
10	王建		6	59	4.0	6.0
11	欧阳曙光		2	44	2.0	2.0