cDNA芯片制备条件的优化

• 作者: 吴常信 李宁 李长绿 王秀利
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: cDNA芯片 杂交 点样 优化
• 年，卷（期）: 2005,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 516-523
• 页数: 8页
• 分类号: S18
• 字数: 7542字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2005.04.022

摘要

应用SpotBotTM芯片点样仪对4种不同的芯片点样液(3×SSC、50%DMSO、3×SSC+1.5 mol/L甜菜碱和MSP)和5个不同公司生产的7种芯片片基(UltraGAPSTM、GAPSⅡ、SuperAmine、SuperAmine Barcoded、Baio氨基载玻片、PL-100C多聚-L-赖氨酸片基和POLY-PREPTM片基)进行了比较分析,发现UltraGAPSTM、GAPSⅡ、SuperAmine和SuperAmine Barcoded片基用3×SSC+1.5 mol/L甜菜碱能得到最佳的点样和杂交结果.同时对克隆PCR产物的扩增和纯化方法、用于点样的DNA样品的浓度、点样环境条件(温度、相对湿度等)、点样后芯片的处理方法、探针的标记方法、芯片的杂交及杂交后的处理等进行了比较、分析和优化.应用优化后的条件成功地在每张芯片上点制27 648个点,并杂交、扫描得到高质量的芯片结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李宁	中国农业大学农业生物技术国家重点实验室	317	6076	42.0	63.0
2	吴常信	中国农业大学农业生物技术国家重点实验室	215	3854	33.0	53.0
3	王秀利	中国农业大学农业生物技术国家重点实验室	3	34	3.0	3.0
4	李长绿	中国农业大学农业生物技术国家重点实验室	5	59	4.0	5.0