海湾扇贝g型溶菌酶基因cDNA的克隆与分析

• 作者: 宋林生 杨官品 胥炜 邹慧斌
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 海湾扇贝 非特异性免疫 EST cDNA文库 g型溶菌酶 分子进化
• 年，卷（期）: 2005,（7）
• 所属期刊栏目: 资源环境技术
• 页码范围: 101-106
• 页数: 6页
• 分类号: Q7
• 字数: 4752字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2005.07.020

摘要

通过EST和锚定PCR技术,从海湾扇贝(Argopecten irradians)中克隆得到一种溶菌酶基因的全长cDNA(全长659bp,编码200个氨基酸).BLASTx分析的结果显示,它和脊椎动物g型溶菌酶相似性较高,却不同于无脊椎动物中已发现的c型和i型溶菌酶.在其编码的氨基酸序列中发现了g型溶菌酶的活性中心(Glu 82, Asp 97, Asp 108),同时6个保守的半胱氨酸也与鸟类和鱼类的g型溶菌酶相一致.结合BLASTX分析的结果,可以确认所获得的cDNA序列是一种在无脊椎动物中首次发现的g型溶菌酶的编码序列.采用Clustalw 软件,对多种脊椎动物c型、g型溶菌酶和无脊椎动物c型、i型溶菌酶以及本研究发现的无脊椎动物g型溶菌酶进行了分析,结果发现,无脊椎动物c型、i型溶菌酶和脊椎动物c型溶菌酶同源性较高,而海湾扇贝g型溶菌酶和脊椎动物g型溶菌酶同源性较高.由此说明c型、g型溶菌酶从无脊椎到脊椎动物的进化是平行发生的,这对进一步研究溶菌酶及其分子进化具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨官品	中国海洋大学海洋生命学院	77	830	17.0	25.0
2	宋林生	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学开放实验室	54	1680	26.0	40.0
3	胥炜	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学开放实验室	9	407	9.0	9.0
4	邹慧斌	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学开放实验室	2	34	2.0	2.0