基因芯片检测拉米夫定引起的乙型肝炎病毒基因YMDD变异的研究

• 作者: 刘伟 刘全俊 刘新珏 周镇先 张林 张汉荣 曹新民 赵伟
• 来源期刊: 南京医科大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 基因芯片 拉米夫定 病毒变异 乙型肝炎病毒
• 年，卷（期）: 2005,（9）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 637-640
• 页数: 4页
• 分类号: R575.2
• 字数: 2951字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-4368.2005.09.008

摘要

目的:建立乙型肝炎病毒(HBV)变异基因诊断芯片,对拉米夫定治疗慢性乙型肝炎过程中出现的肝炎病毒P基因区YMDD变异进行快速准确的检测诊断.方法:设计特异性寡核苷酸探针.用点样法制备HBV变异基因诊断芯片.选择住院患者30例服用拉米夫定后,HBVDNA转阴[＜500拷贝(opies/ml)]68周后又反跳≥5 000 copies/ml的患者进行基因芯片杂交检测.同时用PCR直接测序法对30例患者血清标本进行双盲HBVDNA聚合酶活性区域测序对照.结果:30例服药后HBVDNA反跳患者中基因芯片测得HBV YMDD变异21例,其中YVDD变异11例,YIDD变异10例.直接序列测定发现有核苷酸A741变为G,使氨基酸由蛋氨酸552变为缬氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YVDD)11例,有6例核苷酸A669变为C,使氨基酸由亮氨酸528变为蛋氨酸;核苷酸G743变为T,使氨基酸由蛋氨酸552变为异亮氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YIDD)10例.其中有3例伴有核苷酸T781变为C,使氨基酸由亮氨酸565变为脯氨酸.其结果与基因芯片完全一致.结论:HBV变异基因诊断芯片可以同时检测YVDD、YIDD变异,同PCR直接测序法比较,准确率达100%,无假阳性.