表面活性剂辅助蛋白质体外折叠:分子模拟

• 作者: 刘志霞 刘铮 卢滇楠 张敏莲 王君
• 来源期刊: 化工学报
• 关键词: 分子模拟 HP模型 表面活性剂 折叠中间态 动态Monte Carlo模拟 蛋白质体外折叠
• 年，卷（期）: 2005,（6）
• 所属期刊栏目: 生物化学工程、制药、食品和天然产物加工
• 页码范围: 1063-1069
• 页数: 7页
• 分类号: O629.73|TQ936.21
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0438-1157.2005.06.019

摘要

采用分子模拟方法考察表面活性剂与蛋白质分子之间的相互作用及其对蛋白质折叠过程热力学特性的影响,蛋白质分子构建采用HP模型并引入了方阱类势函数.模拟结果显示:模型蛋白分子的某些折叠中间态会陷入局部能量最低状态而无法完成折叠;弱疏水性表面活性剂对模型蛋白的稳定性影响小,但可有效地帮助处于局部能量最低状态的蛋白折叠中间态通过能量壁垒而实现折叠;强疏水性表面活性剂则可与蛋白质形成高稳定性的复合物而阻止折叠的进行,需将其脱除才能使折叠过程重新开始.模拟结果还显示:表面活性剂的加入会使蛋白质折叠中间态更加丰富,从而能够光滑折叠过程中的能量阱;表面活性剂与变性环境对于蛋白质的折叠具有协同效应.模拟结果与文献报道的实验结果具有一致性,显示分子模拟的方法在揭示蛋白质折叠过程的微观机理以及表面活性剂类折叠助剂的分子设计方面有很好的应用前景.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘铮	清华大学化学工程系	101	2012	24.0	42.0
2	卢滇楠	清华大学化学工程系	31	578	10.0	23.0
3	张敏莲	清华大学化学工程系	13	220	8.0	13.0
4	王君	清华大学化学工程系	154	72	6.0	7.0
5	刘志霞	清华大学化学工程系	1	6	1.0	1.0