计算机辅助药物分子对接并行演化设计

• 作者: 李纯莲 王希诚 赵金城
• 来源期刊: 计算机辅助设计与图形学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 分子对接 结合位点 遗传算法 信息熵 并行计算
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 所属期刊栏目: CAD/CAT/CAM/CG系统设计与应用技术
• 页码范围: 168-173
• 页数: 6页
• 分类号: O631
• 字数: 4744字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1003-9775.2005.01.026

摘要

对分子对接理论作了简单介绍,建立了一个基于柔性配体分子与刚性受体分子对接的数学规划模型,将分子对接中的构象优化搜索转化为求解约束极小化问题的过程,并采用带有空间收缩的多种群并行遗传算法进行求解.在分布式存储的并行机曙光3000上模拟计算表明,该设计具有很高的并行加速比,在保证分子对接的准确性和有效性的前提下,大大提高了分子构象搜索的速度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李纯莲	大连理工大学电子与信息工程学院计算机科学与工程系	39	116	4.0	9.0
3	赵金城	大连大学生物信息学与分子设计研究所	15	168	9.0	12.0
4	王希诚	大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室	54	538	12.0	21.0