乙型肝炎病毒基因组前-前-S和前-X区基因分布的研究

• 作者: 庄辉 方钟燎 杜珩 段学章
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 乙型肝炎病毒 基因组 前-前-S序列 前-X序列
• 年，卷（期）: 2005,（5）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 348-350
• 页数: 3页
• 分类号: R3
• 字数: 2437字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2005.05.002

摘要

目的研究不同基因型乙型肝炎病毒(HBV)前-前-S和前-X区核苷酸和氨基酸序列分布. 方法应用DNAstar软件中的MegAlign程序分析GenBank登记的35株和3株由本室测定的不同基因型HBV全序列中前-前-S和前-X区基因分布情况,并用Blast软件对GenBank中598株HBV全基因组序列进行前-前-S和前-X区的核苷酸和氨基酸相似性分析. 结果除D基因型外,在各型HBV基因组中均存在前-前-S区核苷酸序列,但仅在C、F和H型HBV基因组中存在前-前-S区开放读码框架(ORF).但前-X区核苷酸序列及其ORF仅见于C基因型HBV.在GenBank登记的598株不同基因型HBV中,与推导的前-前-S区相似氨基酸序列有36株,而与推导的前-X区相似的氨基酸序列有47株. 结论前-前-S区序列存在于除D基因型以外的所有HBV基因型,而前-X区基因仅存在于C基因型HBV基因组中.