仿刺参(Apostichopus japonicus)mtDNA三个基因片段的序列分析

• 作者: 刘萍 孙慧玲 李颖 王清印 马甡 高天翔
• 来源期刊: 海洋与湖沼
• 学科: 生物学
• 关键词: 仿刺参 mtDNA 16S rRNA基因 COI基因 序列比较
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 页码范围: 143-153
• 页数: 11页
• 分类号: Q346
• 字数: 4520字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0029-814X.2006.02.008

摘要

采用PCR技术对中国烟台、威海和莱州三个地点仿刺参的16S rRNA、COI、IrRNA-COI三个mtDNA基因片段进行了扩增和测序,分别得到了长度约为570bp、640bp和900bp的三段序列,分析了三个采样点样品的遗传多样性.结果表明,每段基因序列扩增均获得两种单倍型,已在Genbank中注册(注册号码:AY852278-AY852283).通过比较,三个地点样品的序列差异不显著,无缺失、插入、颠换的现象,只有个别位点出现转换,其中16S rRNA序列最为保守,16S rRNA、COI、IrRNA-COI三段序列A+T的平均含量为56.2%、59.2%、61.8%,均大于G+C含量.三个采样点样品同源性为99.84%-99.96%.将获得的仿刺参DNA序列和Genbank中的来自东太平洋8个外群进行基因序列比较,结果发现,不同目、科的海参的序列差异显著.采用DNAsp统计了各类位点数;MEGA2.1分析了碱基组成和遗传距离,构建了系统树.系统树体现的分类关系与这些物种的形态学分类关系完全一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘萍	中国水产科学研究院黄海水产研究所	124	3043	33.0	48.0
2	马甡	中国海洋大学水产学院	94	1535	22.0	35.0
3	孙慧玲	中国水产科学研究院黄海水产研究所	15	292	11.0	15.0
4	王清印	中国水产科学研究院黄海水产研究所	118	3069	34.0	50.0
5	高天翔	中国海洋大学水产学院	154	2739	28.0	41.0
6	李颖	中国水产科学研究院黄海水产研究所	53	399	10.0	17.0