迷向周期和方法在β-簮结构折褶模拟中的应用

• 作者: Bernard R.Brooks 吴雄武
• 来源期刊: 南京工业大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: β-簮结构 分子动态模拟 肽折褶 溶剂化 迷向周期和 长程作用
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 页码范围: 34-40
• 页数: 7页
• 分类号: TQ426.94
• 字数: 513字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7627.2006.01.008

摘要

采用新近提出的迷向周期和方法(IPS),结合自导Lang evin动态模拟,模拟研究9余肽折褶成β簮结构的情况,表明了该结构与NMR观察到的基本一致,而Ewald模拟由于是强烈的镜像相互作用会产生构型偏差,获得致密构型的几率增大,表明IPS方法更适合于周期边界条件的模拟.