牙鲆MHC classⅡB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析

• 作者: 张玉喜 陈松林
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 主要组织相容性复合体 MHC Ⅱ多态性 抗病力 牙鲆
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 页码范围: 633-639
• 页数: 7页
• 分类号: S917|S94
• 字数: 3868字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2006.05.009

摘要

用fmhcN1 和 fmhcC1 引物分别从 42尾感病个体和42尾抗病个体的基因组DNA中扩增MHC基因片段,扩增产物长度为268/280 bp.在268/280 bp的核苷酸序列中,有32个(11.4%)核苷酸位点是多态的.在其编码的61个氨基酸位点中,有13个位点是多态的,其中有6个位点发生在多肽结合位点上.对核苷酸替代的类型及位点进行分析,发现非多肽结合位点的非同义碱基替代率与同义碱基替代率的比值(dN/dS) (0.523)远远小于多肽结合位点的非同义碱基替代率与同义碱基替代率的比值(dN/dS) (23.091),表明氨基酸替换集中出现在exon2多肽结合位点上.分析84个个体的411个阳性克隆的测序结果,发现有13 个不同的MHC class ⅡB等位基因,并且分别编码 13个不同的氨基酸序列.其中大部分等位基因如a,b,c,d,e,f,j,k,i,m是两个群体共有的,等位基因d 在感病群体中出现的频率(23.80%)显著高于在抗病群体中出现的频率(7.14%).而等位基因g和h只出现在13个抗病个体中,其频率分别为21.4% 和 9.52%;等位基因l只出现在感病群体中,其频率为 19.05%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈松林	中国水产科学院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室	65	1094	20.0	30.0
2	张玉喜	中国水产科学院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室	2	64	2.0	2.0