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碱性土壤微生物基因的克隆和多样性分析
碱性土壤微生物基因的克隆和多样性分析
作者:
梁璇
武波
胡婷婷
蒋承建
隆文杰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
宏基因组
文库
未培养微生物
碱性蛋白酶
β-葡萄糖苷酶
摘要:
从碱性土壤样品中直接抽提和分离宏基因组DNA, 首先构建了包含5 562个阳性克隆的碱性土壤16S rDNA文库, 随机抽取9个克隆测序后构建的系统进化树表明了碱性土壤环境微生物种群基因的多样性.纯化土壤宏基因组DNA后采用EcoRⅠ酶部分酶切处理, 我们又构建了以pGEM-3Zf(+)为载体的DNA部分文库AL01.AL01文库包含23650个克隆, 随机插入载体的外源DNA片段平均大小为3.2 kb左右, DNA文库的总容量为75.68 Mb.建库效率为从每克环境样品中获得6 000个左右的含随机外源DNA片段插入载体的克隆.采用酶活筛选策略, 我们从AL01文库中筛选到一个编号为pGXAA2011的阳性克隆携带有一个完整的碱性蛋白酶基因.蛋白酶活性检测其酶活作用最佳温度为40℃, 最适作用pH 值为9.5.另外, 我们还克隆和表达了一个新型β-葡萄糖苷酶基因unglu01, 该基因和现有数据库中的β-葡萄糖苷酶基因没有任何DNA或者氨基酸水平的同源性.将unglu01基因的ORF与表达载体pETBlue-2连接后导入宿主菌株Tuner(DE3)pLacI中, 该重组表达克隆在含柠檬酸高铁铵和七叶苷的LA平板上表现清晰的β-葡萄糖苷酶活性, SDS-PAGE电泳可以检测到29 kDa大小的目的蛋白.
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碳源
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引文网络
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相关基金
期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
(/次)
(/年)
文献信息
篇名
碱性土壤微生物基因的克隆和多样性分析
来源期刊
遗传
学科
农学
关键词
宏基因组
文库
未培养微生物
碱性蛋白酶
β-葡萄糖苷酶
年,卷(期)
2006,(10)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1287-1293
页数
7页
分类号
S1
字数
5094字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:0253-9772.2006.10.017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
武波
广西大学微生物及植物遗传工程教育部重点实验室
56
665
16.0
23.0
2
蒋承建
广西大学微生物及植物遗传工程教育部重点实验室广西亚热带资源保护利用重点实验室
12
63
3.0
7.0
3
胡婷婷
广西大学微生物及植物遗传工程教育部重点实验室广西亚热带资源保护利用重点实验室
1
13
1.0
1.0
4
梁璇
广西大学微生物及植物遗传工程教育部重点实验室广西亚热带资源保护利用重点实验室
1
13
1.0
1.0
5
隆文杰
广西大学微生物及植物遗传工程教育部重点实验室广西亚热带资源保护利用重点实验室
2
14
1.0
2.0
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
(25)
参考文献
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节点文献
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同被引文献
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参考文献(1)
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二级引证文献(7)
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二级引证文献(11)
2016(9)
引证文献(0)
二级引证文献(9)
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2019(4)
引证文献(0)
二级引证文献(4)
2020(1)
引证文献(0)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
宏基因组
文库
未培养微生物
碱性蛋白酶
β-葡萄糖苷酶
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
遗传
主办单位:
中国遗传学会
中国科学院遗传与发育生物学研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-9772
CN:
11-1913/R
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号院
邮发代号:
2-810
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
3898
总下载数(次)
19
总被引数(次)
79934
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
重点项目
学科类型:
信息技术
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