广州地区婴幼儿感染Noro病毒基因型的初步研究

• 作者: 区文玑 周荣 朱冰 钟家禹 龚四堂
• 来源期刊: 中国循证儿科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: Noro病毒 GⅡ-4基因型 同源性比较 进化树分析
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 273-278
• 页数: 6页
• 分类号: R1
• 字数: 4302字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-5501.2006.04.006

摘要

目的 探讨广州地区婴幼儿腹泻中感染Noro病毒的基因型.方法 用Clustal W比对GⅡ组Noro病毒后,设计处于ORF 1与ORF 2连接点两旁两对简并引物,进行巢式RT-PCR扩增出目标片段,克隆于T载体上,测定序列,对ORF1与ORF 2连接点两旁序列和衣壳蛋白N/S区用Clustal W进行同源性分析,用phylip 3.65软件、邻接法构建进化树.结果 标本NVgz100、NVgz10成功扩增出ORF 1与ORF 2连接点两旁1 208 bp片段(相对于Hawaii virus,U07611位置为4476-5683),包含ORF 1的3′端RdRp的大部分基因和ORF 2基因的5′端的S区.对标本NVgz100、NVgz10与另一实验NVgz01(DQ369797)的1 208 bp进行同源性分析发现,3份标本与G Ⅰ组同源性为58%～61%,与GⅡ组同源性为74%～92%;将这3份标本与G Ⅰ、GⅡ组构建进化树,可发现NVgz100、NVgz10和NVgz01与GⅡ组Bristol等病毒密切相关,将NVgz100、NVgz10和NVgz01的衣壳蛋白N/S区与GⅡ组各基因型进行同源性比较,发现3份标本与GⅡ-4基因型Camberwell、Bristoh Grimsby同源性较高(92%～96%),与其他基因型同源性为70%～73%,以N/S区构建进化树可发现3份标本与Camberwell、Bristol、Grimsby、Lordsdale处于同一簇中.结论 本实验结果表明Noro病毒株以GⅡ组为主,病毒流行的基因型为与Camberwell、Bristol、Grimsby和Lordsdale等密切相关的GⅡ-4基因型.F

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱冰	广州市儿童医院中心实验室	34	359	8.0	18.0
2	龚四堂	广州市儿童医院消化科	39	401	13.0	17.0
3	周荣	广州市儿童医院中心实验室	24	132	7.0	10.0
4	区文玑	广州市儿童医院消化科	24	253	11.0	15.0
5	钟家禹	广州市儿童医院中心实验室	10	54	4.0	7.0