2株创伤弧菌的16S-23S rDNA间区的克隆、测序及分析

• 作者: 何建国 欧普 王智学 邓先余 陈晓艳
• 来源期刊: 遗传学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 创伤弧菌 16S-23S rDNA间区 tRNA基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 微生物遗传学
• 页码范围: 365-372
• 页数: 8页
• 分类号: Q933
• 字数: 1462字
• 语种: 中文

摘要

根据细菌的16S rDNA 3'端和23S rDNA 5'端的高度保守区设计引物,PCR扩增了2株创伤弧菌(Vibrio vulnificus)的16S-23S rDNA间区(Intergenic spacer,IGS),克隆到pGEM-T载体上,测序.用BLAST和DNAstar软件对16S-23SrDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析.结果表明,2株创伤弧菌共测出9条16S-23S rDNA间区序列,其中ZSU006测出5条,间区类型分别为:IGSGLAV、IGSGLV、IGSIA、IGSA和IGSG.其中IGSGLAV最大,包含tRNAGlu、tRNALys、tRNAAla和tRNAVal基因;IGSGLV包含tRNAGlu、tRNALys和tRNAVal基因;IGSIn,则包含tRNAIle和tRNAAla基因;IGSG仅包含tRNAGlu基因;而IGSA仅包含tRNAAla基因.菌株CG021测出的16S-23S rDNAIGS序列有4条,除缺少IGSA外,其余的IGS类型均与ZSU006的相同.与GenBank内的创伤弧菌ATCC27562的IGS序列比较,发现创伤弧菌所有类型的IGS的tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性.16S-23S rDNA间区结构的差异为建立一种新的创伤弧菌检测方法奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓先余	湖南科技大学生命科学学院	16	252	9.0	15.0
3	何建国	中山大学生命科学学院	127	2323	26.0	41.0
4	陈晓艳	暨南大学生物工程系	13	124	8.0	11.0
5	王智学	中山大学生命科学学院	8	76	5.0	8.0
8	欧普	湖南科技大学生命科学学院	1	5	1.0	1.0