稻瘟菌无毒基因AVR-Pikm的定位

• 作者: 国立耘 张国珍 张连洪 彭友良 燕继晔 赵文生
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 稻瘟病菌 SSR标记 无毒基因 染色体定位
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 病原学
• 页码范围: 116-122
• 页数: 7页
• 分类号: S435.111.41|Q933
• 字数: 4141字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0412-0914.2006.02.004

摘要

无毒基因是病原物中决定寄主抗病性表达与否的功能基因,其功能的丧失导致毒性小种的产生.在先前的研究中,本研究小组从稻瘟病菌中分离了与无毒基因AVR-Pikm连锁的2个SCAR标记SCO12946和SCE121406.在本研究中,作者首先通过TAC克隆末端核苷酸序列的测定及其与70-15全基因组序列的比较,将这2个标记定位到稻瘟菌第1号染色体上;然后,利用稻瘟菌70-15全基因组草图序列和SSR技术,又分离了与无毒基因AVR-Pikm连锁的4个SSR标记:SSR47T34、SSR50CA24、SSR52TAGG18和SSR56A28.进一步分析表明:上述4个SSR标记位于与SCO12946和SCE121406相反的一侧,与AVR-Pikm位点的遗传距离分别为4.90、7.01、19.12和21.94cM,无毒基因AVR-Pikm位于SCE121406和SSR47T34之间.本研究获得的稻瘟菌无毒基因AVR-Pikm的精细定位为通过染色体步移克隆该基因奠定了基础.