钩端螺旋体蛋白质相互作用网络预测与系统分析

• 作者: 刘琪 孙景春 徐晋麟 曹建平 李亦学 石铁流 郭晓奎
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 问号钩端螺旋体 蛋白质相互作用网络 基因融合法 基因邻居法 系统发生谱法 操纵子法
• 年，卷（期）: 2006,（9）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1049-1057
• 页数: 9页
• 分类号: Q5
• 字数: 7649字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2006.09.009

摘要

问号钩端螺旋体是一种致病菌, 能够引起人畜共患病. 该细菌全基因组序列测序的完成, 为从全蛋白质组学的角度分析蛋白质相互作用网络提供了基础. 本研究通过整合4种计算方法(基因融合法、基因邻居法、系统发生谱法和操纵子法)来预测钩端螺旋体赖株蛋白质相互作用网络. 对运动和趋化系统、信号传导系统、脂多糖生物合成以及黏附、侵袭等有关蛋白质之间的相互作用进行了详细分析. 除此以外, 根据蛋白质的相互作用网络以及功能分类, 预测了203个未知蛋白质可能的功能. 这不仅为进一步研究钩端螺旋体赖株的致病机制提供了一个资料, 也为在基因组范围内应用生物信息学方法研究微生物提供了一个实例.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭晓奎	上海第二医科大学病原微生物教研室	43	241	8.0	13.0
2	刘琪	上海交通大学生命科学技术学院	16	118	6.0	10.0
3	徐晋麟	上海交通大学生命科学技术学院	11	196	6.0	11.0
4	孙景春	上海交通大学生命科学技术学院	2	37	2.0	2.0
5	曹建平	电子科技大学生物医学工程系	2	24	2.0	2.0
6	石铁流	上海生命科学院生命信息中心生物信息中心	1	4	1.0	1.0
7	李亦学	上海生命科学院生命信息中心生物信息中心	1	4	1.0	1.0