海蓬子DnaJ-like基因片段的表达和生物信息学分析

• 作者: 任丽娟 周春霖 张大栋 汤日圣 王茂文 马鸿翔
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: DnaJ-like基因 表达 生物信息学分析 海蓬子
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 页码范围: 222-224
• 页数: 3页
• 分类号: Q786
• 字数: 1736字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2006.03.007

摘要

从盐生植物海蓬子的抑制消减杂交文库中克隆了DnaJ-like基因的长609 bp的DNA序列,编码1个202aa的开放阅读框,Northern Bloting显示该基因在检测子(200 mmol/L NaCl)中的表达显著增强.生物信息学分析表明,在蛋白质水平上,该片段与拟南芥和水稻的同源性分别为6e-68和1e-58;在核酸水平上,该片段与拟南芥的同源性为3e-24.保守区分析显示,该片段含有DnaJ-like基因完整的J功能域(J-Domain, 66aa),功能域在蛋白质水平与GenBank两种相关类型的J功能域的同源性分别为1e-11和9e-15.这为该基因的克隆及研究其在植物逆境胁迫中的作用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汤日圣	江苏省农业科学院农业生物遗传生理研究所	28	843	17.0	28.0
2	张大栋	江苏省农业科学院农业生物遗传生理研究所	16	507	8.0	16.0
3	马鸿翔	江苏省农业科学院农业生物遗传生理研究所	157	1572	21.0	30.0
4	任丽娟	江苏省农业科学院农业生物遗传生理研究所	37	783	17.0	27.0
5	周春霖		4	50	2.0	4.0
6	王茂文		4	27	2.0	4.0