新成人腹泻轮状病毒J19株VP2、VP3的编码基因序列分析

• 作者: 唐青 崔晓英 杨红彦 毕烨 纪绍忠 蒋盛军 阚飙 高守一
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 新成人腹泻轮状病毒 J19株 基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 172-175
• 页数: 4页
• 分类号: R373.2
• 字数: 3418字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2006.03.003

摘要

利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法,从新成人腹泻轮状病毒J19株的核酸中扩增基因,克隆至pMD18-T中并进行测序和基因序列分析.J19株的VP2、VP3的编码基因为基因2、4,分别长2 969bp、2 204bp,它们分别编码973个氨基酸和719个氨基酸.J19株的VP2蛋白序列对B组人轮状病毒IDIR株的一致性为47.2%;J19株的VP3蛋白序列对C组人轮状病毒Cowden株一致性为25.1%.对J19株VP2的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置靠近外群蛋白以及A、B和C组轮状病毒分枝的根部,并且它比较偏向于B组轮状病毒的分枝.这与VP6的遗传进化分析结果相一致.根据上述结果推测J19株可能是一个与B组轮状病毒的起源和进化密切相关的毒株之一;同时,这表明VP2在研究轮状病毒的遗传进化上具有重要价值.关于新成人腹泻轮状病毒J19株VP2、VP3的编码基因的序列分析,这是首次报道.