深圳海域斑节对虾野生种群线粒体控制区序列的多态性分析

• 作者: 周发林 姜永杰 江世贵 马之明 黄建华
• 来源期刊: 南方水产
• 学科: 农学
• 关键词: 斑节对虾 线粒体 控制区序列 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 54-57
• 页数: 4页
• 分类号: Q523+.8|S917
• 字数: 2209字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2006.01.011

摘要

采用聚合酶链式反应技术对深圳斑节对虾种群的20个个体进行了分析,通过对mtDNA的控制区基因序列进行扩增,获得了大小约为650 bp的扩增产物.PCR产物经纯化后进行序列测定,得到了526bp的核苷酸序列.用Clustal_X排序软件对控制区序列进行了对位排列.通过Mega软件对所得线粒体控制区序列的片段进行比较,共检测出114个碱基存在变异,其中包括84个简约信息位点,5个碱基存在插入/缺失;并用Mega的"Pairwise distance"计算个体间的相对遗传距离.结果表明:其序列差异(转换+颠换)在0.010～0.154之间,得出20个个体有20种单倍型;并构建了UPGMA和NJ系统树.运用DNASP软件计算所得该群体核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.05278和27.500.研究结果表明:深圳斑节对虾野生种群控制区序列个体变异程度很大,该种群的遗传多样性水平很高,适合于群体内及群体间不同个体的遗传多样性分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江世贵	中国水产科学研究院南海水产研究所	100	1501	22.0	31.0
2	周发林	中国水产科学研究院南海水产研究所	46	696	17.0	24.0
3	姜永杰	中国水产科学研究院南海水产研究所	4	53	4.0	4.0
7	黄建华	中国水产科学研究院南海水产研究所	49	612	17.0	22.0
8	马之明	中国水产科学研究院南海水产研究所	23	391	12.0	19.0