鲤春病毒糖蛋白(G)基因的分离及同源性比较

• 作者: 孙效文 梁利群 欧阳红生 牟振波 耿波
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲤春病毒病 糖蛋白 序列同源性 分离株
• 年，卷（期）: 2006,（z1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 450-454
• 页数: 5页
• 分类号: S9
• 字数: 2394字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-5464.2006.z1.099

摘要

通过RT-PCR和巢氏PCR方法从疑似鲤春病毒(SVCV)侵染的镜鲤肝组织中获得了鲤春病毒糖蛋白(G)基因.通过序列测定与分析,所获得的鲤春病毒糖蛋白(G)基因由606个核苷酸组成,编码一个由202个氨基酸组成的糖蛋白.通过NCBI blast与9个来自不同国家或地区的鲤春病毒糖蛋白(G)基因序列比对分析,发现获得的鲤鱼春季病毒糖蛋白G基因DNA序列与美国分离的AY527273株同源性最高为99.8%,与中国分离的AY842485株同源性次高为98.7%,与英国分离的两个序列SVI538065和SVI538066株的同源性为98.2%,而与其它国家的分离株如SVU18101、SVI318079、SVI538061、SVI538062、SVI538063的同源性最差,仅为89.4%～90.0%.氨基酸同源性分析结果与DNA同源性分析结果一致,所获得的鲤春病毒糖蛋白G基因氨基酸推导序列与其它9个分离株的氨基酸同源性在89.6%～99.5%之间.对SVCV不同分离株遗传变异和进化关系的分析为下一步开展SVCV快速诊断方法的研究和疫苗的研制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	牟振波	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	82	889	16.0	22.0
2	孙效文	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	159	3935	35.0	57.0
3	耿波	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	16	271	7.0	16.0
5	梁利群	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	91	2491	28.0	47.0
8	欧阳红生		63	213	8.0	10.0