新成人腹泻轮状病毒J19株的全基因组克隆和VP4、VP6和VP7基因序列分析

• 作者: 唐青 崔晓英 杨红彦 毕烨 纪绍忠 蒋盛军 阚飙 高守一
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 新成人腹泻轮状病毒 J19株 基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 413-420
• 页数: 8页
• 分类号: R373.2
• 字数: 5864字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2006.06.001

摘要

为了进一步了解新成人腹泻轮状病毒J19株的基因和蛋白特征,利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增J19株的11个基因,克隆到pMD18-T载体中并进行测序.在此基础上,将主要抗原蛋白VP4、VP6和VP7的蛋白序列与其它轮状病毒的相关蛋白序列进行比较分析并对VP6蛋白序列做遗传进化分析.结果获得J19株11个基因的全长基因序列.基因序列分析表明J19株的第3、6和第9基因分别长2 512bp、1 287bp和820bp,它们分别预测编码抗原蛋白VP4(823aa)、VP6(396aa)和VP7(258aa).组成J19株的VP4、VP6和VP7蛋白序列对B组轮状病毒的CAL株、IDIR株以及ADRV株的相关蛋白序列的一致性分别是27.6%、38.5%和22.3%.对分组抗原蛋白VP6的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置靠近外群蛋白分支以及A、B和C组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向于B组轮状病毒的分支.J19株的VP4、VP6和VP7蛋白序列与其它轮状病毒的相应蛋白序列存在显著差异.VP6蛋白序列的遗传进化分析表明J19株可能是一个新组轮状病毒的代表性毒株;同时,它也可能是一个与B组轮状病毒的起源和进化密切相关的毒株之一.关于新成人腹泻轮状病毒J19株11个基因的克隆及VP4、VP6和VP7基因的序列分析,这是第一次报道.